Considerado por la crítica especializada como un auténtico autor del cine actual, generalmente aborda el género de la comedia, pero con elementos melancólicos. Familias disfuncionales, el abandono, el adulterio o la pérdida de la inocencia. Su estilo estético se obsesiona por la simetría, con un encuadre pictórico, acompañado de maravillosos travellings y planos cenitales llenos de significación. Anderson construye un realismo mágico en una variada paleta de nítidos colores y stop motion (Isle of Dogs). Sus realizaciones, como director y guionista crean una auténtica ilusión cinematográfica.